Мартини-Клиник соответствует международной системе менеджмента качества и сертифицирована в соответствии со стандартом DIN EN ISO 9001:2000.
Кроме того, клиника относится к одним из первых центров по лечению рака простаты, которые прошли сертификацию по строгим критериям в конце 2007 года Немецким Онкологическим обществом. Независимый институт сертификации „OnkoZert“ ежегодно проверяет соблюдение профессиональных критериев.